Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept4P28661 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sept4P28661 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept4P28661 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept4P28661 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sept4P28661 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sept4P28661 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sept4P28661 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept4P28661 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept4P28661 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept4P28661 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept4P28661 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept4P28661 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept4P28661 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sept4P28661 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept4P28661 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sept4P28661 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sept4P28661 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sept4P28661 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sept4P28661 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sept4P28661 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sept4P28661 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms