Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af2P26369 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af2P26369 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af2P26369 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af2P26369 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
U2af2P26369 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af2P26369 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af2P26369 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af2P26369 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2af2P26369 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2af2P26369 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2af2P26369 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af2P26369 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af2P26369 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af2P26369 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms