Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hoxd11P23813 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxd11P23813 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxd11P23813 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxd11P23813 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms