Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd12P23812 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxd12P23812 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd12P23812 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms