Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd8P23463 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd8P23463 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd8P23463 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.2 ms