Protein–RNA interactions for Protein: P22227

Zfp42, Zinc finger protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp42P22227 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp42P22227 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp42P22227 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp42P22227 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms