Protein–RNA interactions for Protein: P22005

Penk, Proenkephalin-A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PenkP22005 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PenkP22005 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PenkP22005 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PenkP22005 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PenkP22005 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PenkP22005 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PenkP22005 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PenkP22005 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PenkP22005 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PenkP22005 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PenkP22005 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PenkP22005 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PenkP22005 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PenkP22005 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PenkP22005 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PenkP22005 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PenkP22005 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PenkP22005 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PenkP22005 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PenkP22005 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PenkP22005 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PenkP22005 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PenkP22005 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PenkP22005 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PenkP22005 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PenkP22005 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PenkP22005 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PenkP22005 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PenkP22005 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PenkP22005 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PenkP22005 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PenkP22005 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PenkP22005 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PenkP22005 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PenkP22005 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PenkP22005 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PenkP22005 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PenkP22005 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PenkP22005 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PenkP22005 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PenkP22005 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PenkP22005 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PenkP22005 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PenkP22005 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PenkP22005 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PenkP22005 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PenkP22005 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PenkP22005 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PenkP22005 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PenkP22005 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PenkP22005 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PenkP22005 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PenkP22005 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PenkP22005 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PenkP22005 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PenkP22005 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PenkP22005 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PenkP22005 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PenkP22005 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PenkP22005 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PenkP22005 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PenkP22005 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PenkP22005 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PenkP22005 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PenkP22005 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PenkP22005 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PenkP22005 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PenkP22005 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PenkP22005 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PenkP22005 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PenkP22005 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PenkP22005 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PenkP22005 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PenkP22005 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PenkP22005 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PenkP22005 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PenkP22005 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PenkP22005 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PenkP22005 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PenkP22005 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PenkP22005 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PenkP22005 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PenkP22005 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PenkP22005 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PenkP22005 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PenkP22005 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PenkP22005 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PenkP22005 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PenkP22005 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PenkP22005 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PenkP22005 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PenkP22005 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PenkP22005 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PenkP22005 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PenkP22005 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PenkP22005 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PenkP22005 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PenkP22005 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PenkP22005 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PenkP22005 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms