Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ms4a1P19437 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ms4a1P19437 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a1P19437 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ms4a1P19437 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms