Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpraP18052 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpraP18052 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpraP18052 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpraP18052 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpraP18052 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpraP18052 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtpraP18052 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpraP18052 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtpraP18052 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtpraP18052 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtpraP18052 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpraP18052 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtpraP18052 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpraP18052 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtpraP18052 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms