Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msh3P13705 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh3P13705 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh3P13705 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh3P13705 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh3P13705 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msh3P13705 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh3P13705 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh3P13705 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh3P13705 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Msh3P13705 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msh3P13705 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh3P13705 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms