Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amd1P0DMN7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Amd1P0DMN7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms