Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd7P0C872 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd7P0C872 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Jmjd7P0C872 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms