Protein–RNA interactions for Protein: P0C242

Ccno, Cyclin-O, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnoP0C242 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CcnoP0C242 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CcnoP0C242 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CcnoP0C242 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcnoP0C242 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcnoP0C242 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcnoP0C242 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcnoP0C242 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcnoP0C242 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcnoP0C242 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcnoP0C242 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CcnoP0C242 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CcnoP0C242 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CcnoP0C242 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CcnoP0C242 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcnoP0C242 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms