Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb5P09079 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb5P09079 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb5P09079 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb5P09079 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxb5P09079 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxb5P09079 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb5P09079 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb5P09079 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb5P09079 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms