Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NeflP08551 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NeflP08551 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NeflP08551 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NeflP08551 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NeflP08551 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NeflP08551 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NeflP08551 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NeflP08551 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NeflP08551 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NeflP08551 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NeflP08551 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NeflP08551 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NeflP08551 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NeflP08551 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NeflP08551 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NeflP08551 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NeflP08551 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NeflP08551 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NeflP08551 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NeflP08551 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NeflP08551 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NeflP08551 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NeflP08551 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NeflP08551 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NeflP08551 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NeflP08551 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NeflP08551 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NeflP08551 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NeflP08551 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NeflP08551 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NeflP08551 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NeflP08551 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NeflP08551 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NeflP08551 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NeflP08551 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NeflP08551 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NeflP08551 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NeflP08551 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NeflP08551 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NeflP08551 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NeflP08551 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NeflP08551 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NeflP08551 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NeflP08551 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NeflP08551 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NeflP08551 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NeflP08551 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NeflP08551 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NeflP08551 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NeflP08551 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NeflP08551 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NeflP08551 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NeflP08551 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NeflP08551 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NeflP08551 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NeflP08551 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NeflP08551 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NeflP08551 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NeflP08551 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NeflP08551 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NeflP08551 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NeflP08551 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NeflP08551 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NeflP08551 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NeflP08551 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NeflP08551 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NeflP08551 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NeflP08551 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NeflP08551 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NeflP08551 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NeflP08551 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NeflP08551 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NeflP08551 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NeflP08551 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NeflP08551 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NeflP08551 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NeflP08551 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NeflP08551 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NeflP08551 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NeflP08551 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NeflP08551 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NeflP08551 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NeflP08551 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NeflP08551 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NeflP08551 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NeflP08551 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NeflP08551 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NeflP08551 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NeflP08551 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NeflP08551 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NeflP08551 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NeflP08551 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NeflP08551 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NeflP08551 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NeflP08551 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NeflP08551 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NeflP08551 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NeflP08551 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NeflP08551 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms