Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Me1P06801 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Me1P06801 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Me1P06801 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Me1P06801 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Me1P06801 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Me1P06801 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Me1P06801 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Me1P06801 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Me1P06801 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Me1P06801 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Me1P06801 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Me1P06801 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Me1P06801 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Me1P06801 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Me1P06801 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Me1P06801 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Me1P06801 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Me1P06801 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Me1P06801 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Me1P06801 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Me1P06801 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Me1P06801 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Me1P06801 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Me1P06801 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Me1P06801 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Me1P06801 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Me1P06801 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Me1P06801 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Me1P06801 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Me1P06801 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Me1P06801 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Me1P06801 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Me1P06801 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Me1P06801 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Me1P06801 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Me1P06801 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Me1P06801 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Me1P06801 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Me1P06801 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Me1P06801 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Me1P06801 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Me1P06801 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Me1P06801 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Me1P06801 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Me1P06801 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Me1P06801 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Me1P06801 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Me1P06801 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Me1P06801 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Me1P06801 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Me1P06801 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Me1P06801 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Me1P06801 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Me1P06801 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Me1P06801 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Me1P06801 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Me1P06801 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Me1P06801 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Me1P06801 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Me1P06801 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Me1P06801 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Me1P06801 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Me1P06801 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Me1P06801 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Me1P06801 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Me1P06801 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Me1P06801 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Me1P06801 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Me1P06801 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Me1P06801 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Me1P06801 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Me1P06801 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Me1P06801 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Me1P06801 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Me1P06801 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Me1P06801 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Me1P06801 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Me1P06801 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Me1P06801 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Me1P06801 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Me1P06801 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Me1P06801 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Me1P06801 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Me1P06801 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Me1P06801 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Me1P06801 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Me1P06801 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Me1P06801 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Me1P06801 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Me1P06801 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Me1P06801 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Me1P06801 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Me1P06801 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Me1P06801 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Me1P06801 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms