Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa4P06798 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxa4P06798 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa4P06798 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.9 ms