Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms