Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col4a1P02463 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col4a1P02463 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col4a1P02463 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col4a1P02463 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col4a1P02463 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col4a1P02463 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Col4a1P02463 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col4a1P02463 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms