Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01739 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01739 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01739 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01739 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01739 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01739 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01739 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01739 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01739 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01739 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01739 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01739 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01739 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01739 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01739 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01739 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01739 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01739 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01739 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01739 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01739 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01739 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01739 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01739 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01739 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01739 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01739 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01739 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01739 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01739 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01739 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01739 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01739 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01739 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01739 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01739 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01739 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01739 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01739 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01739 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01739 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01739 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01739 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01739 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01739 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01739 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01739 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01739 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01739 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01739 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01739 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01739 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01739 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01739 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01739 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01739 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01739 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01739 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01739 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01739 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01739 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01739 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01739 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01739 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01739 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01739 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01739 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01739 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01739 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01739 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01739 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01739 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01739 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01739 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01739 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01739 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01739 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01739 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01739 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01739 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01739 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01739 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01739 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01739 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01739 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01739 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01739 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01739 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01739 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01739 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01739 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01739 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01739 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01739 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01739 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01739 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01739 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01739 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01739 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms