Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01679 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01679 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
P01679 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01679 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01679 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01679 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01679 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01679 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01679 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01679 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01679 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01679 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01679 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
P01679 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01679 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01679 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01679 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01679 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01679 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01679 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01679 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01679 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01679 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01679 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01679 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01679 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01679 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01679 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01679 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01679 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01679 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01679 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01679 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01679 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01679 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01679 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01679 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
P01679 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01679 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01679 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01679 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01679 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
P01679 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01679 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01679 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01679 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01679 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01679 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01679 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01679 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01679 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01679 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01679 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01679 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01679 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01679 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01679 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
P01679 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01679 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01679 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01679 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01679 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01679 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01679 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01679 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01679 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01679 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01679 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01679 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01679 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01679 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01679 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01679 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01679 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01679 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01679 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01679 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01679 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01679 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01679 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01679 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01679 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01679 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01679 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01679 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01679 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01679 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01679 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01679 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01679 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01679 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01679 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01679 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01679 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01679 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01679 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01679 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01679 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01679 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms