Protein–RNA interactions for Protein: P00397

Mtco1, Cytochrome c oxidase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco1P00397 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtco1P00397 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtco1P00397 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtco1P00397 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mtco1P00397 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mtco1P00397 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtco1P00397 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtco1P00397 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtco1P00397 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtco1P00397 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtco1P00397 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtco1P00397 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtco1P00397 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtco1P00397 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mtco1P00397 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mtco1P00397 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms