Protein–RNA interactions for Protein: O89084

Pde4a, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4aO89084 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde4aO89084 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pde4aO89084 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Pde4aO89084 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde4aO89084 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms