Protein–RNA interactions for Protein: O89051

Itm2b, Integral membrane protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2bO89051 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itm2bO89051 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itm2bO89051 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itm2bO89051 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itm2bO89051 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms