Protein–RNA interactions for Protein: O89033

Cdc6, Cell division control protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc6O89033 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms