Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn2O88552 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn2O88552 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn2O88552 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn2O88552 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn2O88552 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn2O88552 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn2O88552 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn2O88552 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn2O88552 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn2O88552 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn2O88552 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cldn2O88552 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn2O88552 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms