Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnmt3aO88508 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dnmt3aO88508 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnmt3aO88508 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnmt3aO88508 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms