Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc1O88447 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klc1O88447 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc1O88447 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc1O88447 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klc1O88447 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klc1O88447 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc1O88447 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc1O88447 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc1O88447 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc1O88447 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc1O88447 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klc1O88447 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klc1O88447 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klc1O88447 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klc1O88447 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klc1O88447 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klc1O88447 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klc1O88447 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klc1O88447 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms