Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx7O70439 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx7O70439 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx7O70439 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx7O70439 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx7O70439 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx7O70439 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx7O70439 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx7O70439 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx7O70439 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx7O70439 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx7O70439 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx7O70439 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx7O70439 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms