Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lnx1O70263 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lnx1O70263 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lnx1O70263 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lnx1O70263 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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