Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cer1O55233 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cer1O55233 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cer1O55233 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cer1O55233 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cer1O55233 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cer1O55233 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cer1O55233 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cer1O55233 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cer1O55233 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cer1O55233 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cer1O55233 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cer1O55233 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cer1O55233 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cer1O55233 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cer1O55233 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms