Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51dO55230 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.8 ms