Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syngr2O55101 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr2O55101 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr2O55101 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms