Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk2a2O54833 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk2a2O54833 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk2a2O54833 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms