Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SpibO35906 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SpibO35906 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SpibO35906 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SpibO35906 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SpibO35906 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SpibO35906 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SpibO35906 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SpibO35906 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SpibO35906 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SpibO35906 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SpibO35906 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SpibO35906 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SpibO35906 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SpibO35906 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SpibO35906 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SpibO35906 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SpibO35906 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SpibO35906 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SpibO35906 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpibO35906 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpibO35906 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpibO35906 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpibO35906 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpibO35906 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpibO35906 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpibO35906 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpibO35906 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SpibO35906 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SpibO35906 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SpibO35906 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SpibO35906 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SpibO35906 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SpibO35906 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SpibO35906 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SpibO35906 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SpibO35906 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SpibO35906 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SpibO35906 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpibO35906 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpibO35906 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpibO35906 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpibO35906 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpibO35906 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpibO35906 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpibO35906 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpibO35906 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpibO35906 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SpibO35906 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SpibO35906 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SpibO35906 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SpibO35906 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SpibO35906 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SpibO35906 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SpibO35906 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SpibO35906 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SpibO35906 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SpibO35906 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SpibO35906 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SpibO35906 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SpibO35906 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SpibO35906 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SpibO35906 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SpibO35906 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SpibO35906 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SpibO35906 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SpibO35906 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SpibO35906 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SpibO35906 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SpibO35906 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SpibO35906 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SpibO35906 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SpibO35906 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SpibO35906 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SpibO35906 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SpibO35906 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SpibO35906 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SpibO35906 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SpibO35906 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SpibO35906 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SpibO35906 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SpibO35906 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SpibO35906 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SpibO35906 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SpibO35906 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SpibO35906 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SpibO35906 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SpibO35906 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SpibO35906 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SpibO35906 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SpibO35906 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SpibO35906 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SpibO35906 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SpibO35906 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SpibO35906 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SpibO35906 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SpibO35906 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SpibO35906 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SpibO35906 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SpibO35906 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms