Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ccl25O35903 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl25O35903 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl25O35903 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl25O35903 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl25O35903 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl25O35903 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl25O35903 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl25O35903 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl25O35903 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl25O35903 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl25O35903 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl25O35903 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl25O35903 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl25O35903 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl25O35903 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl25O35903 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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