Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Timm44O35857 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Timm44O35857 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Timm44O35857 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Timm44O35857 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Timm44O35857 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Timm44O35857 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Timm44O35857 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Timm44O35857 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Timm44O35857 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Timm44O35857 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Timm44O35857 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Timm44O35857 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Timm44O35857 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Timm44O35857 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Timm44O35857 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Timm44O35857 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Timm44O35857 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Timm44O35857 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Timm44O35857 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Timm44O35857 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Timm44O35857 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Timm44O35857 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Timm44O35857 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Timm44O35857 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Timm44O35857 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Timm44O35857 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Timm44O35857 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Timm44O35857 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Timm44O35857 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Timm44O35857 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Timm44O35857 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Timm44O35857 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms