Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn6O35646 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn6O35646 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn6O35646 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn6O35646 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn6O35646 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn6O35646 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn6O35646 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn6O35646 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn6O35646 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn6O35646 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn6O35646 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Capn6O35646 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn6O35646 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn6O35646 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn6O35646 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn6O35646 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn6O35646 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Capn6O35646 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms