Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnxbO35452 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnxbO35452 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TnxbO35452 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TnxbO35452 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TnxbO35452 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TnxbO35452 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TnxbO35452 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TnxbO35452 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TnxbO35452 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnxbO35452 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnxbO35452 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TnxbO35452 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnxbO35452 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TnxbO35452 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms