Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eftud2O08810 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eftud2O08810 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eftud2O08810 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eftud2O08810 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms