Protein–RNA interactions for Protein: O08638

Myh11, Myosin-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh11O08638 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh11O08638 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh11O08638 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh11O08638 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh11O08638 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh11O08638 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh11O08638 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myh11O08638 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myh11O08638 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Myh11O08638 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Myh11O08638 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myh11O08638 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myh11O08638 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myh11O08638 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myh11O08638 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myh11O08638 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myh11O08638 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Myh11O08638 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Myh11O08638 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Myh11O08638 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms