Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3542K7N6U2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3542K7N6U2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3542K7N6U2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms