Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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Gm379J3QQ19 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Gm379J3QQ19 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Gm379J3QQ19 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm379J3QQ19 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Gm379J3QQ19 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Gm379J3QQ19 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm379J3QQ19 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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