Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28051J3QMA2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28051J3QMA2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.4 ms