Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp17lcG5E8I7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp17lcG5E8I7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp17lcG5E8I7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
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