Protein–RNA interactions for Protein: G3XA57

Rab11fip2, Rab11 family-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip2G3XA57 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab11fip2G3XA57 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab11fip2G3XA57 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip2G3XA57 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 254.2 ms