Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrna9G3X8Z7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrna9G3X8Z7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chrna9G3X8Z7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms