Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmigd3G3X8R9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmigd3G3X8R9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmigd3G3X8R9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmigd3G3X8R9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmigd3G3X8R9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmigd3G3X8R9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmigd3G3X8R9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmigd3G3X8R9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmigd3G3X8R9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmigd3G3X8R9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmigd3G3X8R9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmigd3G3X8R9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmigd3G3X8R9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmigd3G3X8R9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmigd3G3X8R9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmigd3G3X8R9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmigd3G3X8R9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmigd3G3X8R9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmigd3G3X8R9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmigd3G3X8R9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmigd3G3X8R9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmigd3G3X8R9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmigd3G3X8R9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms