Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r39G3UWE6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r39G3UWE6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r39G3UWE6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r39G3UWE6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r39G3UWE6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r39G3UWE6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r39G3UWE6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r39G3UWE6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r39G3UWE6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r39G3UWE6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r39G3UWE6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r39G3UWE6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms