Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdh11xF6ZNL5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdh11xF6ZNL5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms